Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLSTN1O94985 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms