Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F6O75461 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F6O75461 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F6O75461 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F6O75461 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F6O75461 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms