Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP2AO43633 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms