Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F3O00716 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms