Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BQF6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BQF6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BQF6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BQF6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BQF6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BQF6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H3BQF6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H3BQF6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
H3BQF6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H3BQF6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
H3BQF6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
H3BQF6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BQF6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BQF6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BQF6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BQF6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BQF6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BQF6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BQF6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BQF6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BQF6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms