Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BECN2A8MW95 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN2A8MW95 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms