Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms