Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf170A2RU37 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms