Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms