Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 COL4A4-201ENST00000396625 9895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HERC1Q15751 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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