Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP4-210ENST00000638482 3084 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TAC4-201ENST00000326219 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-120P-201ENST00000363009 157 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNK16-203ENST00000425054 1272 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004006.1-201ENST00000434994 377 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL022313.2-201ENST00000442579 372 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01883-201ENST00000457385 380 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL748P-201ENST00000483066 311 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 STX1B-202ENST00000565419 834 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010615.2-204ENST00000600469 830 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.85-201ENST00000610909 260 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.149-201ENST00000613165 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC20-204ENST00000445522 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL391421.1-201ENST00000372387 1922 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BRDT-203ENST00000370389 3696 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms