Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 AC146949.1-201ENST00000505946 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC146944.1-201ENST00000508439 418 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC073913.2-201ENST00000541512 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 FLJ21408-202ENST00000565060 565 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC015818.5-201ENST00000578659 356 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 MIR3650-201ENST00000581972 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC091132.5-201ENST00000590995 560 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC091810.1-201ENST00000603131 325 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 MCRIP2P2-201ENST00000605276 209 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AL139098.2-201ENST00000608233 381 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 OSBPL6-206ENST00000409045 3427 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 BBS12-201ENST00000314218 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 LINGO4-201ENST00000368820 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 ELF3-203ENST00000367284 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PRAMEF4-201ENST00000235349 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 GBP6-201ENST00000370456 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SH3GL2-201ENST00000380607 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM107-208ENST00000532998 2358 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 CALCR-201ENST00000359558 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PNPLA8-201ENST00000257694 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 TRIM62-201ENST00000291416 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF587B-203ENST00000594901 2118 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 STK38-201ENST00000229812 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 HPSE2-203ENST00000370552 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 PAXIP1-201ENST00000397192 3711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC12A4-203ENST00000537830 3525 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC22A24-202ENST00000417740 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP5-3Q6L8H2 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms