Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ALG1L11P-201ENST00000511660 450 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CCDC25-201ENST00000356537 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GSTCD-211ENST00000515279 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SRP54-208ENST00000555557 1949 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC01929-201ENST00000589125 3067 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CHEK2-208ENST00000404276 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PHKA1-203ENST00000373542 6020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PCDHGC3-201ENST00000308177 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CACNA1E-203ENST00000360108 6970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 STEAP3-203ENST00000393110 4262 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL031666.2-201ENST00000599904 2253 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RSPH10B-203ENST00000405415 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CUL2-203ENST00000374749 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DDX11-229ENST00000545668 3751 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LRRC4C-204ENST00000530763 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 HIF3A-205ENST00000377670 5852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PLAGL1-204ENST00000367572 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ANXA7-202ENST00000372921 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 JAM2-201ENST00000312957 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MEIS1-216ENST00000560281 2773 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SPINT3-201ENST00000217428 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SLPI-201ENST00000338380 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNU105C-201ENST00000362342 209 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC087491.1-201ENST00000398554 616 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC064862.3-201ENST00000411435 571 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RPL23AP66-201ENST00000494341 479 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC104561.1-201ENST00000521021 630 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PDE4DIP-247ENST00000618504 567 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RBM19-202ENST00000392561 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PDPN-202ENST00000376057 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NCAM1-213ENST00000531044 2826 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MAPK10-240ENST00000639175 2596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SSU72-202ENST00000359060 4176 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LEP-201ENST00000308868 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ADAM17-201ENST00000310823 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CLDN19-203ENST00000539749 3517 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 OGDHL-202ENST00000419399 3588 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PLSCR4-201ENST00000354952 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SLC22A14-201ENST00000273173 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MTMR10-202ENST00000563714 2216 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CTCFL-222ENST00000609232 3668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NLRC5-217ENST00000539144 6505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DDR1-AS1-206ENST00000458361 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CARMN-201ENST00000505254 3950 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FGF1-204ENST00000378046 2582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 KIAA1257-201ENST00000265068 6034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AP005230.1-205ENST00000639316 2015 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AZI2-212ENST00000479665 4706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AP000892.3-201ENST00000624094 5326 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RAD9B-204ENST00000409300 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CTAGE14P-201ENST00000397819 2403 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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