Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 IPO7P2-201ENST00000451446 1750 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ANKUB1-201ENST00000446160 2419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OR4C7P-201ENST00000533375 919 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC089998.3-201ENST00000549715 493 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TEX46-203ENST00000622840 479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PROX2-202ENST00000556489 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SERPINA9-202ENST00000337425 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PRDM10-205ENST00000526082 3308 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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