Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms