Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms