Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3AQ9Y496 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms