Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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TPCN1Q9ULQ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPCN1Q9ULQ1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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TPCN1Q9ULQ1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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TPCN1Q9ULQ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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TPCN1Q9ULQ1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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TPCN1Q9ULQ1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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TPCN1Q9ULQ1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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TPCN1Q9ULQ1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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TPCN1Q9ULQ1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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TPCN1Q9ULQ1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPCN1Q9ULQ1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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