Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms