Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATPIF1Q9UII2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms