Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms