Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms