Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNPLA3Q9NST1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNPLA3Q9NST1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms