Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIT2Q9NQR4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms