Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms