Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN2Q9H4D0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms