Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN1Q9GZU1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN1Q9GZU1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN1Q9GZU1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN1Q9GZU1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN1Q9GZU1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN1Q9GZU1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN1Q9GZU1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN1Q9GZU1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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