Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLIRPQ9GZT3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms