Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF1Q9BYJ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms