Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms