Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms