Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC94Q9BW85 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms