Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB1Q9BVT8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms