Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms