Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LARP6Q9BRS8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LARP6Q9BRS8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms