Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms