Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA1CQ9BQE3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA1CQ9BQE3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms