Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms