Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms