Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD1Q99460 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD1Q99460 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms