Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3IPQ96QF0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms