Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms