Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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