Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms