Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPS3Q969F9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms