Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms