Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf3Q8WVX3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf3Q8WVX3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms