Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRIM41Q8WV44 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms