Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms