Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PNLDC1Q8NA58 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms